韦峻轩因间接害死爱人胡家琳的父亲胡冠佑而深陷悔恨，却又在韩朗的威胁下被迫与之合作。他原计划联手卧底子弹扳倒韩朗，却未料韩朗暗中揭露子弹好友伍永哲死于峻轩之手，挑动子弹揭发其黑警身份。峻轩因此被羁押，虽因证据被销毁而免于起诉，却永远失去了警察身份。胡冠佑离世后胜联陷入内斗，家琳为保护异母弟弟洛威也卷入权位之争。此时缉毒科总督察张铤暗中联络峻轩，安排他借机加入胜联再度卧底，与同事苏晴配合戴罪立功。在《无间道 第二季》完整无删减版中，峻轩在帮派中饱受排挤，更因家琳得知其参与杀害父亲的真相而反目成仇。